中國水產科學研究院南海水產研究所圖書館始建于1957年，是我國最早的專業研究型圖書館之一。五十多年來，在南海所領導的關懷下，經過幾代圖書館人的辛勤努力和積累建設，圖書館館藏現已涵蓋漁業資源保護與利用、漁業生態環境、水產健康養殖、遺傳育種、生物技術、水產病害防治、水產品加工與綜合利用、水產品質量安全控制、漁業裝備與工程技術和漁業信息等 10 大學科領域，形成了內容豐富、學科齊全、珍品薈萃并具有水產特色的館藏體系。

　　多年來，南海所圖書館堅持“以研究為基礎，以服務為主導”的辦館理念，以數字圖書館為窗口，為讀者提供書刊借閱、信息咨詢與檢索、文獻傳遞、科研參考資料、多媒體資源、軟件應用支持等服務，逐漸成為南海所科研活動中最重要的公共服務體系之一。

　　為加強圖書館館藏資源數字化、信息化建設，進一步優化館藏資源，南海所圖書館從2007年起先后參與水科院的專業圖書數字化加工和數字資源團購，完成了全院數字圖書館建設，并引進國內外數字資源，包括電子期刊、電子圖書、會議論文和學位論文等。本著“水產專業出版物求全、非水產專業求精、外文期刊種類豐富”的服務原則，圖書館不斷充實館藏，截止2012年3月基本館藏紙質文獻達6萬多冊，電子圖書2萬多冊，中外文全文網絡數據庫12個，包括中國知網、維普、萬方、SpringerLink、ScienceDirect、Wiley、Annual Reviews、ProQuest等，以及ASFA（水科學漁業文摘和海洋文摘）、FSTA（食品科技文摘）、CABI(國際農業與生物科學研究中心)等6個文摘庫，深受科研人員歡迎。

　　如今，為加強文獻資源建設的整體規劃，實現文獻資源的最佳利用，為科研人員提供高效、個性化的服務，南海所正在全面建設圖書館網絡服務系統，以“資源共享、服務共建”為思路，在全所實現文獻建設、資源數字化、讀者服務的統一協調。

　　今后，圖書館將根據水產科研創新的需求，對傳統文獻和數字資源進行合理而科學的整合，不斷補充和完善館藏，力爭建成多元化、深層次、優質高效的服務體系，為科研創新提供強有力的信息支撐。